Rus/Eng
Theoretical and Applied Research Journal
Conifers of the boreal area

Editorial board

Article archive

Contacts

Genetic differentiation of Siberian Larch (Larix sibirica Ledeb.) in Middle Siberia Download PDF (146 KB)    

Oreshkova N.V.

 V.N. Sukachev Institute of Forest SB RAS
660036 Krasnoyarsk, Russia, 50 Akademgorodok; e-mail: oreshkova@fromru.com

Volume XXVII, Number 1-2, 2010

 
Abstract

Genetic diversity of Siberian larch (Larix sibirica Ledeb.) in Middle Siberia was inferred from data on 22 genes determining allozyme diversity of 13 enzymes. 31,82 % of the genes proved to be polymorphic. On average, each tree was heterozygous at 9,1 % genes. With Wright’s F statistics, average individual inbreeding was estimated at 1,7 % relative to the population (Fis) and at 5,4 % relative to the species (Fit). Within-population variation accounted for more than 96 % of the total variation, while the contribution of among-population variation was 4 % (Fst = 0,038). The mean genetic distance D between populations ranged from 0,001 to 0,009 and averaged 0,005.

Keywords: Siberian larch, natural population, allozymes, genetic diversity and differentiation

References 


Adams, W.T. Genetics of allozyme variants in Loblolly Pine / W.T. Adams, R.I. Joly // Heredity. - 1980. - Vol. 71. - P. 33-40.

Brewer, G.J. Introduction to isozyme techniques / G.J. Brewer - N.Y.-L.: Academ. press., 1970. - 186 p.

Cheliak, W.L. Population structure and genic diversity in tamarack, Larix laricina (Du Roi) K. Koch / W.L. Cheliak, J. Wang, J.A. Pitel // Can. J. For. Res. - 1988. - Vol. 18. – P. 1318-1324.

Felsenstein, J. PHYLIP – Phylogeny Inference Package (Version 3.2)/ J. Felsenstein // Cladistics. - 1989. – V.5. – P. 164-166.

Fins, L. Genetic variation in allozymes of western larch. / L. Fins, L.W. Seeb // Can. J. Forest. - 1986. -Vol. 16. - P. 1013-1018.

Guries, R.P. Inheritance of some polymorphic isoenzymes in pitch pine (Pinus rigida Mill.) / R.P. Guries, F.T. Ledig // Heredity. – 1978. - Vol. 40. - P. 27-32.

Lewandowski, A. Levels and patterns of allozyme variation in some European larch (Larix decidua) populations / A. Lewandowski, L. Mejnartowicz // Hereditas (Landskrona). - 1991. -V. 115, № 3. - P. 221-226.

Manchenko, G.P. Handbook of detection of enzymes on electrophoretic gels / G.P. Manchenko. - CRC Press, Ins. 1994. - 574 p.

Mantel, N. The detection of disease clustering and a generalized regression approach / N. Mantel // Cancer Research. – 1967. - № 27. – P. 209-220.

Markert, C.L. Lactate dehydrogenase isozyme patterns in fish / C.L. Markert, I. Faulhaber // Exp. Zool. 1965. - Vol. 159. - P. 319-332.

Nei, M. Genetic distance between populations / M. Nei // Amer. Natur. 1972. Vol. 106. P. 283‑291.

Oreshkova, N.V. Genetic diversity, structure and differentiation of Gmelin larch (Larix gmelinii (Rupr.) Rupr.) populations from Central Evenkia and Eastern Zabaikalje / N.V. Oreshkova, A.Y. Larionova, L.I. Milyutin, A.P. Abaimov // Eurasian Journal of Forest Research. - 2006. - Vol. 9-1. - P. 1-8.

Peakall, R. GenAlEx V6: Genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research / R. Peakall, P.E. Smouse // Molecular Ecology Notes. – 2006. – V.6, № 1. – P. 288-295.

Ridgeway, G.J. Polymorphism in the Esterases of Atlantic Harring / G.J. Ridgway, S.W. Sherburne, R.D. Lewis // Trans. Am. Fish. Soc. - 1970. - Vol. 99. - P. 147-151

Semerikov, V.L. Intra- and interspecific allozyme variability in Eurasian Larix Mill. species / V.L. Semerikov,

L.F. Semerikov, M. Lascoux // Heredity. - 1999. – Vol. 82. - P. 193-204.

Shaw, C.R. Starch gel electrophoresis of enzymes – a compilation of recipes / C.R. Shaw, R. Prasad // Biochem. Genet. – 1970. - Vol. 4. - P. 297-320.

Sokal, R.R. Biometry, 3rd ed / R.R. Sokal, F.J. Rohlf. - N.Y.-W.H.: Freeman and Company. 1994. - 888 p.

Vallejos, C.E. Enzyme activity staining / C.E. Vallejos. // Isozymes in plant genetics and breeding. Pt.A / Eds. Tanksley S.D., Orton T.J. Amsterdam: Elsevier Sci. Publ. 1983. - P. 469-516.

Wright, S. Evolution and the genetics of population. V. 4. Variability within and among natural populations / S. Wright // Chicago, Illinois: Univ. Chicago Press, 1978.

Yakhneva (Oreshkova), N.V. Genetic polymorphism of Larix sibirica and Larix gmelinii in the Middle Siberia / N.V. Yakhneva (Oreshkova), A.Ya. Larionova // Improvement of larch (Larix sp.) for better growth, stem form and wood quality: Proceedings of an international symposium. – France, 2002. – P. 19-24.

Yeh, F.C.H. POPGENE Version 1.32: Microsoft Windows – based Freeware for population genetic analysis. / F.C.H. Yeh, R. Yang, T. Boyle // 1999.

Ying, L. The population structure of Larix laricina in New Brunswick. Canada / L. Ying, E.K. Morgenstern // Silvae Genet. - 1991. - Bd. 40, H. 5. - S. 180-184.Айала, Ф. Введение в популяционную и эволюционную генетику/ Ф. Айала. – М.: Мир, 1984. – 230 с.

Гончаренко, Г.Г. К вопросу о генетической изменчивости и дифференциации лиственницы курильской (Larix kurilensis Mayr) и лиственницы японской (Larix kaempferi Sarg.) / Г.Г. Гончаренко, А.Е. Силин // ДАН. - 1997. - Т. 354, № 6. - С. 835-838.

Гончаренко, Г.Г. Руководство по исследованию древесных видов методом электрофоретического анализа изоферментов / Г.Г. Гончаренко, В.Е. Падутов // Гомель: Бел-НИИЛХ, 1988. – 66 с.

Дылис, Н.В. Лиственница Восточной Сибири и Дальнего Востока / Н.В. Дылис. – М.: АН СССР, 1961. – 209 с.

Дылис, Н.В. Лиственница. / Н.В. Дылис // Библиотечка «Древесные породы» - М.: Лесная промышленность, 1981. - 96 с.

Дылис, Н.В. Сибирская лиственница / Н.В. Дылис. – М.: Изд. МОИП, 1947. – 137 с.

Ирошников, А.И. Лиственницы России. Биоразнообразие и селекция / А.И. Ирошников. – М.: ВНИИЛМ, 2004. – 182 с.

Классификация и номенклатура ферментов. - М.: Изд-во Иностранная литература, 1962.

Коропачинский, И.Ю. Древесные растения Сибири / И.Ю. Коропачинский. – Новосибирск: Наука, 1983. – 383 с.

Ларионова, А.Я. Генетическая изменчивость лиственницы сибирской в Нижнем Приангарье / А.Я. Ларионова, Н.В. Яхнева (Орешкова), Н.А. Кузьмина // Лесоведение. - 2003. - № 4. - С. 17-22.

Ларионова, А.Я. Генетическая изменчивость лиственницы сибирской из Южного Забайкалья / А.Я. Ларионова // Флора, растительность и растительные ресурсы Забайкалья: Тезисы докладов. - Чита. 1997. - С. 100-101.

Ларионова, А.Я. Генетический полиморфизм и внутривидовая дифференциация лиственницы сибирской / А.Я. Ларионова // Десятый конгресс дендрологов. Современное состояние общего исследования естественной дендрофлоры с особым учётом сохранения её генофонда. – София, 1988. - С. 239-244.

Ларионова, А.Я. Генетическое разнообразие и дифференциация популяций лиственницы Гмелина в Эвенкии (Средняя Сибирь) / А.Я. Ларионова, Н.В. Яхнева (Орешкова), А.П. Абаимов // Генетика. - 2004. - Т. 40, №10. - С. 1370-1377.

Ларионова, А.Я. О тасономическом положении лиственницы Сукачева (по данным анализа изоэнзимных спектров лейцинаминопептидазы и эстеразы) / А.Я. Ларионова // Хемосистематика и эволюционная биохимия высших растений: Тезисы докладов III Всесоюзной конференции. - Москва. 1986. - С. 85-87.

Милютин, Л.И. Биоразнообразие лиственниц России / Л.И. Милютин // Хвойные бореальной зоны. – 2003. – Вып. 1. - С. 6-9.

Милютин, Л.И. Генетико-таксономический анализ популяций лиственниц сибирской и Сукачева / Л.И. Милютин, Е.Н. Муратова, А.Я. Ларионова // Лесоведение. – 1993. - № 5. - С. 55-63.

Орешкова, Н.В. Аллозимный полиморфизм лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) / Н.В. Орешкова, А.Я. Ларионова // Лесные экосистемы Северо-восточной Азии и их динамика: Материалы международной конференции - Владивосток, 2006. – С. 220 – 223.

Орешкова, Н.В. Аллозимный полиморфизм ферментов лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) и лиственницы Каяндера (Larix cajanderi Mayr) / Н.В. Орешкова // Хвойные бореальной зоны. – 2008. - Т. XXV, № 1-2. - С. 160-167.

Орешкова, Н.В. Генетическое разнообразие лиственницы сибирской в Ужурской лесостепи (Красноярский край) / Н.В. Орешкова, А.Я. Ларионова // Вестник СВНЦ ДВО РАН. – 2007. - № 3. – С. 50-55.

Орешкова, Н.В. Популяционная изменчивость лиственницы Каяндера в республике Саха (Якутия) / Н.В. Орешкова, А.П. Барченков // Вестник Северо-Восточного научного центра ДВО РАН. – 2009. - №1. – С. 81-87.

Семериков, В.Л. Изучение генетической изменчивости лиственницы сибирской (Larix sibirica Ldb.) по изоферментным локусам / В.Л. Семериков, А.В. Матвеев // Генетика. – 1995. - Т.31, № 8. - С. 1107-1113.

Шурхал, А.В. Аллозимный полиморфизм лиственницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.) / А.В. Шурхал, А.В. Подогас, В.Л. Семериков, Л.А. Животовский // Генетика. - 1989. - Т. 25, № 10. - С. 1899-1901.


____________________

Hosted by uCoz